Domaines de compétence

Collecter, organiser, traiter et modéliser les
données
Analyser BIG data structurées ou non structurées
Préparation et présentation simple des données
Comprendre les avantages et les défis de la
visualisation de données
Connaissances de base sur les différentes
solutions du marché
Utilisation des meilleures pratiques techniques
pour réaliser des analyses
Capacité à partager les résultats de l'analyse via
des applications ou des tableaux de bord en libre-
service
Utilisation des programmes permettant
d'analyser, de traiter et de visualiser les données
Collecter et préparer les données via des API
Effectuer des analyses exploratoires et identifier
les tendances et relations importantes
Application des approches statistique rigoureuse
pour extraire les données factuelles
Faire preuve de créativité en cherchant à en savoir
davantage

Expérience professionnelle

Gustave Roussy (Département de Biologie Médicale) Depuis Déc 2019

Intervenir pour organiser le secteur de bio-informatique du service de génétique des tumeurs et dans le secteur
AMMiCa (unité de recherche clinique) où sont générés des résultats d’analyse moléculaire à destination de la prise
en charge médicale des patients de Gustave Roussy. Cette étape dans l’analyse moléculaire est de plus en plus
cruciale pour assurer la qualité des résultats. Il est nécessaire de coordonner à la fois les pipelines mis en production
et les bases de données pour assurer une juste annotation des anomalies identifiées

Gérer les bio informaticiens du secteur en charge du maintien des pipelines d’analyses et du
développement des outils.
Coordonner la mise en production des pipelines développés par la plateforme de bio-informatique vers
un contexte clinique
Veiller à l’adéquation des ressources serveurs avec les besoins d’analyse et de stockage
Maintenir et faire évoluer le système en place en interaction directe avec les praticiens biologistes
Traitement bio-informatique et statistique des données générées par les séquenceurs
Adéquation du système avec les exigences de la norme ISO15189 du laboratoire de biologie
Mettre en place et gérer les bases données de variants.
Rendre les résultats dans le temps impartis aux différents acteurs impliqués dans le processus
Maintenir à jour / Développer les méthodes protocoles logiciels selon les bonnes pratiques du domaine
Recueillir les besoins des biologistes et proposer des réponses adaptées quant à l'annotation, l'aide à
l'interprétation des données et les évolutions possibles des pipelines et de leur transversalité
Participer à des groupes de travail nationaux et/ou internationaux en lien avec les analyses

Etudes

I NGENIEUR B IOINIFORMATICIEN
D ATA A NALYSTE / D ATA M ANAGER
E XPERT R/S HINY

 

Master 2 Bio-informatique et modélisation
_2016_ Sorbonne université _ Paris 6
Master 2 Réseaux et systèmes distribués _2013_
Université de Bejaia (Algérie)